两段式洗瓶乃是先以清洗剂冲洗杀菌再冲洗无菌水，此种洗瓶方式杀菌效果佳而且比单段式洗瓶机较不会有清洗剂残留于瓶内，所以两段式洗瓶机能使用较高浓度的过醋酸或较高浓度的氯水作为杀菌剂，而我们的两段式洗瓶机采用独立管路设计，当清洗剂与无菌水交替切换时不会有混合现象，确保各段清洗能确实完成，增加杀菌与洗净效果，但客户需能提供无菌水才能使用。