転倒殺菌機は、主に熱充填製品の生産ラインに使用されている。充填キャップ密封を終了した後の瓶内製品温度でキャップ滅菌を行い、逆にする過程は、連続式で瓶を水平以上にして瓶口の空気を瓶底まで完全に排出し、キャップを完全に滅菌する効果を実現することができる。
ボトルを逆にする滅菌時間は、製品特性によって設定する。例えば中性茶は、普通30秒を設定するが、酸性運動飲料水の設定時間が短い。もちろん、お客様に実験データーを提供していただければよい。